Seit 1472 ist die Ruppertsgrüner Kirchgemeinde eine selbständige Parochie, zuvor hatte sie zu Elsterberg gehört. Die Dorfkirche wurde im 30jährigen Krieg durch ein Feuer zerstört; der Wiederaufbau auf den ausgebrannten Mauern des Vorgängerbaus konnte erst 1651 vollendet werden.

Im Jahr 1883 wurde ein neuer Kirchturm an der Südwestseite errichtet, nachdem der alte baufällig geworden war; außerdem erfolgte 1886 eine Restaurierung der gesamten Kirche.